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Die Warnung die du da hast, stammt von rpm, die besagt nur dass er schon eine Konfigurationsdatei gefunden hat, die aber nicht löscht (ich glaub beim Deinstallieren wird in .rpmsave umbenannt, beim Installieren in .orig).
Kannst mal zur Kontrolle rcrpmconfigcheck aufrufen, gibt dir an welche Dateien nicht ersetzt wurden.