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Welche Software ist schon unbedenklich? Wenn der Server in einer Produktivumgebung läuft, würde ich das IMMER erst in einer Testumgebung testen. Schau dir auf jeden Fall die "release notes" aller Versionen nach 3.0.14 an, da sich einige Dinge geändert habe seit der Version. Einige Parameter sind weggefallen, neue sind hinzugekommen und bei manchen hat sie der default Wert geändert.
9.2 ist auch nicht mehr gerade aktuell. Von daher würde ich bei einer Produktivumgebung empfehlen, auf einem Testrechner ein komplettes Update zu auszuprobieren, und bei positivem Ergebnis zu wechseln.
Bei den Zugriffsrechnten solltest Du mal gucken, ob sich an den Rechten am System was geändert hat.